[转让] 双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法

专利类型:发明

合作方式:转让

出售价格: 面议

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摘要

本发明涉及一种双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法,包括压缩存储步骤,和deBruijn图构造步骤。本发明提供的双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法,(1)结合DNA序列互补双螺旋结构的特点,对de?Bruijn图结构进行结构优化,使用双向多步de?Bruijn图,可以将需要存储的图的节点减半;(2)针对序列组装的原始de?Bruijn图规模异常庞大,对内存造成存储压力等问题,使用双向多步de?Bruijn图的压缩存储技术,使得存储双向多步de?Bruijn图的内存消耗控制在参考序列大小的100倍以内;(3)构造双向多步de?Bruijn图,可将DNA序列组装问题分解为边融合子问题,更适合并行计算。

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